Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中都细菌表观遗传标记的存在

2021-10-25 16:23:49 来源:
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引言:在最初阶段,自然界就开始了在不改变菌株细胞会DNA的组织顺序的必要条件下来使其DNA发挥不同的功能,而这就是通过给DNA亚基上添加无机化学标明来实现的。DNA甲基化是两栖类的关键一般话说来突变机制,其之中5-甲基腺嘌呤(5mc)是最相似的DNA润色之一。6mdA是菌株限制性润色系统的基本组合而成成分,目前在两栖类之中缺乏已知的限制性润色系统。此前有不少研究工作报道,6mdA也共存于两栖类之中,但并无确凿背书。

近日,在《社会科学进展》上的一项研究工作之中,瑞典林雪平大学的研究工作执法人员证明,两栖类细胞会之中共存菌株一般话说来突变标明很确实被污染物了,并且未足够的确凿来证明两栖类之中共存这种润色。

N6-甲基腺嘌呤(6mdA)是菌株之中广泛应用的DNA润色,但最近在两栖类DNA之中也给与了举例来说。然而,研究工作执法人员说,即使对来自相同两栖类细胞会特性的DNA进行的6mdA都可和总质量测定研究工作也不一致。

为了再进一步阐明6mdA在两栖类谱系规格之中的依赖性,研究工作执法人员利用了体外将全人类荒唐T辅助(NTH)细胞会分化为TH细胞会亚群的能力。但是,与此前的研究工作相反,他们见到TH分化过程之中6mdA的总质量未以外局变化,并且注意到到分化的T细胞会之中的6mdA素质与尚未甲基化的以外线粒体扩增DNA相同,这证明6mdA并尚未以可检验的素质共存全人类T细胞会之中。

他们还分析了从六个全人类细胞会系之中分离显露的DNA之中的6mdA,并鉴定显露两个有着高于背景噪声素质的6mdA素质的细胞会系。显露乎意料的是,两种单独的293T细胞会系培养若无有着不同的6mdA素质,这证明研究工作执法人员注意到到的6mdA接收器并非细胞会特性本身固有的。确实,当他们再进一步看时,他们见到两条6mdA素质上升的细胞会系被真核细胞属污染物,真核细胞属一种相似的菌株细胞会培养若无之中高含量6mdA的污染物若无。当他们用真核细胞特异性抗生素Plasmocin处理事件细胞会系时,6mdA接收器增大为A阴性相异。

“我们意识到通过这些技术检验到的6mdA'接收器'只是噪声。但是,由于一些复杂的技术问题,几种方法之中的背景噪声不是随机的,而是真实接收器。”高级译者Colm Nestor(科尔姆·内斯特)在一份声明之中话说。

研究工作执法人员分析了以前通过DNA免疫沉淀分子可生若无学、质谱和单分子可实时分子可生若无学在两栖类细胞会之中取向或检验6mdA的努力。人们见到每种方法都有局限性或不足之处,使一般话说来突变标明的假阳性见到率很高,似乎证明林雪平研究工作执法人员认为不共存这种现象的确凿。

这组译者说:“我们证明,RNA和菌株污染物、抗体交叉反应性和其他技术限制的结合已导致6mdA在两栖类DNA之中的重复差错辨认。随着DNA和RNA润色家族的不断增长,以及以前尚未知润色的丰富性日益稀有,即使用到多种表征方法,我们也强调了差错见到的确实性。我们建议用到润色和尚未润色的线粒体DNA标准化作为今后对稀有DNA润色的研究工作的最低要求,以及在用到前更以外面地验证抗体特异性。”

内斯特补充话说,研究工作执法人员在研究工作非常稀有的现象时必须非常轻轻,选择用到哪种方法,并考虑他们究竟真正在衡量共存的事若无。他话说:“现在我们可以毫无疑问地话说两栖类之中不共存6mdA。关于6mdA,如果研究工作执法人员停止研究工作根本不共存的两边,则可以节省大量时间和报酬,并且避免了很多感到难过的事情。”

最初显露处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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