生活在化学物质十二指肠内的菌种在化学物质的代谢、免疫等方面都展现着至关重要的作用，菌种流失会导致一系列性疾患的发生，比如克罗恩患（CD）和其他形式的慢性患肠患(IBD)等。但这些密切联系假象的生态学有助于仍不明确。澳大利亚麻省荣民总医院(MGH)布罗德数据分析所(Broad Institute)和哈佛所学院(Harvard Medical School)的数据分析管理人员现在辨认出，一种与克罗恩患相关的、原是活泼排泄立克次体(Ruminococcus gnus)的细菌会释放某种单糖类(或糖类化学键氨基酸)，诱发免疫反应。R.gnus电镜照片该数据分析发表在《PNAS》上，是最早揭示十二指肠有机体与人类性疾患中间相似性有助于的数据分析之一。“这是一种独特的化学键，代表了十二指肠有机体与慢性患性疾患中间的潜在密切联系，”第一作者Matthew Henke感叹。“有机体菌种与性疾患的相似性数据分析越来越多，”HMS的生物化学与化学键生物化学任教Clardy感叹，“有些一致性颇为最弱，但有些很弱，但总归都是相关的。”R.gnus与CD相关大约有200万澳大利亚人身患慢性患肠患(IBD)，包括克罗恩患。布罗德核心数据分析所(Broad core institute)核心成员、传染患和有机体第三组计划创设联系主任Ramnik Xier的研究所此前的明，在克罗恩患的某些爆发期，R.gnus在十二指肠菌种的丰度可以从不足1%跃升至超过50%。Xier，Clardy和Henke想要通过试验中者确定克罗恩患与R.gnus中间的密切联系，其假象的生态学有助于究竟是干什么？慢性患单糖类于是，数据分析团队在研究所之中培养出R.gnus孢子后，对该细菌显现出的所有化学键同步进行了鉴定，以确定究竟依赖于促炎特异性。他们辨认出R.gnus合成并分泌物不具备鼠李糖类支架和侧氨基酸的复合单糖类。进一步数据分析声称，该单糖类主要由三个鼠李糖类静态逐步形成的线性支架和由两个静态逐步形成的短侧氨基酸分成。鼠李糖类支架由1,2-和1,3-连结的鼠李糖类静态制成，侧氨基酸不具备与1,6-连结的末端。这个单糖类能有效诱发细胞体细胞分泌物炎性细胞特异性（TNFα），并且TNFα分泌物依赖于toll样细胞因子4（TLR4）。揭开结构之谜后，他们跟踪了R.gnus的基因序列第三组并鉴定了负责制备这种单糖类的基因序列。下一代的试验中将数据分析这些基因序列究竟在克罗恩患中风早先过度表达。深远制约Henke感叹:“如果我们能一个患人，辨认出这种单糖类的基因序列在患情恶化早先就现在表达出来，那就相当有感叹服力了，这也意味着这种单糖类是克罗恩患中风的缘故。”如果这个论点被证明是正确的，数据分析管理人员可以针对R.gnus生长或其显现出这种慢性患单糖类的战斗能力，共同开发更进一步化疗克罗恩患和类似于慢性患性疾患的方法。有机体第三组的制约是较广的，这些辨认出对克罗恩患以外的其它性疾患除此以外不具备实用性。“现在我们现在创设了这种方法，我们可以快速检测其他细菌，明了有机体第三组促进性疾患的假象化学键有助于，”Xier感叹。早先的数据分析只是声称化学物质十二指肠有机体第三组变化与宿主性疾患状态依赖于相似性，但很少有数据分析探究这些相似性假象的化学键有助于，这项数据分析是第一个数据分析有机体集合起来与人类卫生中间相似性假象的化学键有助于的数据分析，也为今后的数据分析提供颇为MVP的借鉴。原始出处：Matthew T. Henke, Douglas J. Kenny, et al. Ruminococcus gnus, a member of the human gut microbiome associated with Crohn’s disease, produces an inflammatory polysaccharide. PNAS. Jun 2019.
